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中國科學院南海海洋研究所重點研究熱帶邊緣海海洋水圈－地圈－生物圈圈層結構及其相互作用特征與演變規律，探討其對資源形成和環境變化的控制和影響，發展具有南海特色的熱帶海洋資源與環境過程理論體系和應用技術。以生態安全與綠色發展、海-陸-氣相互作用與環境安全、邊緣海與大洋板塊相互作用和島礁工程環境保障為戰略主題，聚焦生態文明和國防安全建設工程，著力突破海洋領域前沿科學問題和關鍵核心技術。重點學科領域：熱帶海洋環境動力與生態過程、邊緣海地質演化與油氣資源、熱帶海洋生物資源可持續利用與生態保護和海洋環境觀測體系及其關鍵技術。
網絡應用
中國科學院南海海洋研究所儀器設備公共服務中心旨在實現大型儀器設備共管、共享、公用，為科研工作提供技術支撐。儀器設備公共服務中心按南海海洋研究所學科發展方向，下設三個技術服務平臺：海洋生物分析平臺、海洋環境與工程分析平臺和船載海洋觀測平臺。海洋生物分析平臺現有儀器15臺，按其功能設7個儀器組。核磁共振組，顯微結構分析組，流式細胞儀組，葉綠素分析組，色譜-質譜分析組，功能基因組分析組，元素分析組。
商業服務
中國科學院邊緣海與大洋地質重點實驗室長期從事南海海洋地質和地球物理研究，有先進的海洋探測儀器設備和調查船，積累有豐富的研究資料，在海洋構造與地球物理、海洋沉積與環境等方面取得了一系列重要成果。中國科學院廣州地球化學研究所長期從事有機地球化學、同位素地球化學和大陸邊緣地質與成礦學研究，有國際一流水平的地球化學測試儀器，在地球化學和大地構造研究方面在國內具有很強的學術優勢。為兩所海洋地質、地球物理、和地球化學等專家開展富有成效的合作提供了良好的工作平臺，形成了在學科配備、人才隊伍和儀器設備等方面具有國際先進水平的一支邊緣海地質研究力量，增強了邊緣海地球動力學及海洋沉積過程與環境研究領域的原始創新能力。
思想學術
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