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環境生物分析、 環境微生物宏基因組學、 資源與環境微生物、 水鳥和濕地生態學、 分子與進化生態學、 廢水生物處理資源化、 污染物生物能源轉化、 膜分離技術、 環境污染的生物過程與效應、 環境污染的生物控制原理與技術、

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中國科學院環境生物技術重點實驗室是面向學科前沿和國家重大需求，系統地開展環境生物技術的理論與應用研究。重點圍繞著環境污染的生物檢測與診斷、環境污染的生物過程與效應、環境污染的生物控制原理與技術三個研究方向，探索生物技術主導的手段和方法，減小或修復環境污染對生物體及其生存環境的危害，強調理論、技術、應用的緊密結合，產生具有科學突破和應用價值的創新成果。。

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